此后不久，他便于2月2日首次登上世界第一的宝座，并在9月13日赢得美网冠军之后锁定年终排名第一2月20日，费德勒在鹿特丹公开赛四分之一决赛中负于亨曼，这是他该赛季的首次失利但他马上夺取了随后的两项巡回赛迪拜公开赛击败洛佩兹和印第安维尔斯大师赛击败亨曼的头衔5月，费德勒在汉堡大师赛中奉献了他最。 接下来的赛季，他在200809年继续为斯图加特效力，依然是12
